MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015574	ATT	2	6	1003705	1003710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015574	CTT	2	6	1005072	1005077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015574	TAA	2	6	1005078	1005083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015574	TGA	2	6	1005090	1005095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015574	AATAAA	2	12	1005135	1005146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015574	TAAA	2	8	1005225	1005232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015574	AAT	2	6	1005240	1005245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015574	T	6	6	1005250	1005255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_015574	TCT	2	6	1005293	1005298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_015574	ATT	2	6	1005310	1005315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015574	TA	4	8	1005325	1005332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015574	TAAAC	2	10	1005342	1005351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_015574	ATT	2	6	1005409	1005414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015574	TTA	2	6	1005472	1005477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015574	AT	3	6	1005497	1005502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015574	TTG	2	6	1005507	1005512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015574	A	6	6	1005525	1005530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015574	ATT	2	6	1005541	1005546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015574	TTAA	2	8	1005548	1005555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015574	AAAGA	2	10	1005562	1005571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015574	GGA	2	6	1005673	1005678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015574	TTGAC	2	10	1009231	1009240	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6023	NC_015574	ATTA	2	8	1009241	1009248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015574	TAAG	2	8	1009254	1009261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015574	ATT	2	6	1009268	1009273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015574	TTG	2	6	1009295	1009300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015574	GAT	2	6	1009330	1009335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015574	GGT	2	6	1009405	1009410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015574	ATT	2	6	1009901	1009906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015574	TTA	2	6	1009907	1009912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015574	AT	3	6	1009943	1009948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015574	GTT	2	6	1009949	1009954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015574	TTA	2	6	1009968	1009973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015574	CT	3	6	1010508	1010513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_015574	CAT	2	6	1010534	1010539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_015574	TAT	2	6	1011044	1011049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015574	A	6	6	1011077	1011082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015574	AGG	2	6	1011089	1011094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015574	T	8	8	1011896	1011903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015574	ATT	2	6	1011983	1011988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015574	ATT	2	6	1012003	1012008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015574	AT	4	8	1012025	1012032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015574	ATT	2	6	1012045	1012050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_015574	TAA	2	6	1012106	1012111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015574	TAA	2	6	1012121	1012126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015574	CATTA	2	10	1012146	1012155	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6047	NC_015574	TCAA	2	8	1012156	1012163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_015574	A	7	7	1012717	1012723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015574	TTA	2	6	1013306	1013311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015574	ATT	2	6	1013315	1013320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015574	AGA	2	6	1013372	1013377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015574	ATA	2	6	1013729	1013734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015574	AT	4	8	1013736	1013743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015574	AAT	2	6	1013753	1013758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015574	TTTAT	2	10	1013768	1013777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015574	A	6	6	1013781	1013786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015574	A	6	6	1013792	1013797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015574	ATTAA	2	10	1013799	1013808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015574	ATTAA	2	10	1013811	1013820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015574	TTA	2	6	1013822	1013827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015574	ATA	3	9	1013829	1013837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015574	TCC	2	6	1014592	1014597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_015574	TTG	2	6	1015782	1015787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015574	AAT	2	6	1015816	1015821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015574	TGAG	2	8	1015825	1015832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015574	AAT	2	6	1015917	1015922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015574	ATTG	2	8	1015924	1015931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015574	TG	3	6	1017071	1017076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015574	ATT	2	6	1017080	1017085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015574	TAAAT	2	10	1017094	1017103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015574	AAT	2	6	1017120	1017125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015574	TAT	2	6	1017186	1017191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015574	TG	3	6	1020590	1020595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_015574	TAA	2	6	1020696	1020701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015574	TC	3	6	1021726	1021731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_015574	A	6	6	1021735	1021740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015574	T	6	6	1021741	1021746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015574	ACA	2	6	1021763	1021768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_015574	T	7	7	1021793	1021799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015574	TGAA	2	8	1021812	1021819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015574	ATA	2	6	1021826	1021831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_015574	ATCT	2	8	1021864	1021871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_015574	TCA	2	6	1022941	1022946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015574	ATA	2	6	1022979	1022984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_015574	AGT	2	6	1023001	1023006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_015574	AAAT	2	8	1024416	1024423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_015574	T	7	7	1024433	1024439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_015574	TTC	2	6	1025529	1025534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015574	ATA	2	6	1025574	1025579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_015574	AT	3	6	1025647	1025652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_015574	ATT	2	6	1025662	1025667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_015574	TGA	2	6	1025672	1025677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015574	TCA	2	6	1025734	1025739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_015574	T	7	7	1028561	1028567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015574	ATG	2	6	1028592	1028597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_015574	T	6	6	1030088	1030093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_015574	TAAATA	2	12	1031155	1031166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015574	TAA	2	6	1031171	1031176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015574	T	7	7	1031198	1031204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015574	TAAT	2	8	1031206	1031213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015574	AAT	2	6	1031225	1031230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015574	TAAT	2	8	1031254	1031261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015574	TAAC	2	8	1031289	1031296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6106	NC_015574	TTTTA	2	10	1031297	1031306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015574	ATT	2	6	1031323	1031328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_015574	TAA	2	6	1031358	1031363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015574	TAA	2	6	1031370	1031375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_015574	T	7	7	1031377	1031383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015574	AATT	2	8	1031412	1031419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015574	TAA	2	6	1031491	1031496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015574	A	6	6	1031525	1031530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015574	GA	3	6	1031558	1031563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015574	T	7	7	1031574	1031580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015574	GAA	2	6	1031600	1031605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015574	T	6	6	1031659	1031664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015574	TGT	4	12	1031701	1031712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015574	AGT	2	6	1031806	1031811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_015574	ATG	2	6	1031880	1031885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015574	TAA	2	6	1031908	1031913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015574	AGAT	2	8	1032037	1032044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015574	TTG	2	6	1032097	1032102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015574	AAAT	2	8	1032143	1032150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015574	TA	3	6	1032188	1032193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015574	ATA	2	6	1032201	1032206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015574	GAA	2	6	1032220	1032225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015574	ATA	2	6	1032241	1032246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015574	ATT	2	6	1032259	1032264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015574	A	9	9	1032271	1032279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_015574	ATT	2	6	1032287	1032292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_015574	ATTT	2	8	1032314	1032321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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